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應用案例

經過20多年的發展,寶德持續而深刻地把握市場需求,積累了海量的客戶資源和豐富的服務經驗

寶德助地壇醫院抗擊埃博拉
案例背景

日前,寶德在首都醫科大學附屬醫院北京地壇醫院(簡稱“地壇醫院”)埃博拉出血熱病例應急設備采購項目中一舉中標,為客戶量身定做的包括硬件建設、系統建設、軟件建設與技術服務在內的HPC集群解決方案,為地壇醫院在埃博拉病毒檢測以及后期病原檢測方面的研究提供了高計算能力、高性能、高存儲的計算平臺,加快了地壇醫院提升埃博拉病毒檢測、病原檢測等生命科學科研水平的步伐。

案例分析

地壇醫院始建于1946年,是北京市衛生局直屬三級甲等醫院,也是北京大學醫學部、北京中醫藥大學教學醫院。國家肝病、艾滋病臨床藥物驗證基地、國家中醫藥管理局中西醫結合傳染病臨床基地均設于此。醫院主要承擔除結核病以外的39種法定傳染病的診治、研究和培訓任務,是一家集醫療、教學、科研、預防為一體的公共衛生臨床醫療機構。2014年8月埃博拉病毒肆虐非洲,疫情瞬息萬變。地壇醫院第一批援幾內亞醫療隊于8 月12日兩小時內集結完畢趕赴西非。針對可能發生的埃博拉出血熱疫情傳入風險,北京市衛生計生委指定地壇醫院為埃博拉出血熱定點收治醫院。中國雖然沒有發現埃博拉病毒患者,但是疑似患者入院治療的情況還是屢有發生。為防止埃博拉病毒入侵我國,地壇醫院啟動了埃博拉出血熱病例應急設備的采購。通過對客戶背景與應用需求的深入分析,結合以往在生物信息與生命科學領域HPC方面的成功案例,寶德最終為客戶確定了基于寶德生物一體機PowerScale8000-B高性能計算機集群系統的解決方案。寶德PowerScale8000-B是一套應用于生物信息計算的一體機,能為客戶在序列比對、序列拼接、GPU 加速方面提供更的高性能保證;它使用目前業界先進的軟件定義存儲,在安全、性能、管理方面能發揮極致性能。

解決方案

寶德PowerScale8000-B高性能計算機集群系統
寶德PowerScale8000-B高性能計算機集群系統作為埃博拉病毒檢測以及地壇醫院后期病原檢測的主要計算單元,配合高通量測序儀一起完成地壇醫院埃博拉病毒應急設備項目,每次要滿足測序儀>150億(15G)堿基數據的計算,并且每次對>2000 萬個片段序列的數據的分析,要滿足98%以上的原始數據的準確性。為此,寶德為客戶設計了一套擁有10.49萬億次計算能力的HPC集群整體解決方案。該方案網絡部分采用雙網分離結構,包括管理網和計算網兩部分,管理網使用一臺千兆交換機實現對所有節點的正常管理;計算網使用超低延遲核心萬兆以太網交換機作為數據傳輸通路,保證數據的無阻塞、高效快速轉發,以便更快地計算出數據結果。存儲部分設計了一套分布式的海量存儲系統,整套系統可提供70TB的可使用空間、800MByete/s的實際使用帶寬,以及60萬/s的IOPS 并發訪問數,以保證數據調用的暢通無阻。事實上,此次與地壇醫院的合作只是寶德HPC解決方案在生命科學行業成功應用的一個縮影,此前,寶德與華大基因、中國科學院北京生命科學院、中國疾病監控中心、嘉寶仁和醫療有限公司等行業客戶在生命科學研究領域展開了全面合作,在該領域積累了大量的客戶與行業經驗。其中,與華大基因的多次合作更是締造了寶德高性能服務器PowerScale繪制全球第一張“黃種人基因圖譜”、寶德Power Cluster8000HPC計算機系統繪制大熊貓基因兩座里程碑。

客戶收益

波士頓咨詢公司(BCG)發布的報告顯示,中國醫療科技市場將在2013 年至2020 期間保持14%的年均增長率,到2020 年,市場規模將增至550億美元,成為全球第二大醫療科技市場。報告預測,到2020年,中國醫療科技市場將超越日本和德國,從2013 年的世界第四位躍升至第二位,占據全球市場份額的13%。目前,國內醫療科研市場HPC應用正處于起步階段,許多國產服務器廠商在醫療科研市場表現乏力,醫療科研市場存在大范圍空白。長期以來,寶德一直致力于國內HPC的應用與普及,憑借在HPC領域的深入研究,寶德大力開拓醫療科研市場,在該領域積累了深厚的經驗,填補了醫療科研市場HPC應用的空白,并為加快我國醫療科研領域的研究成果落地轉化做出了突出的貢獻


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