高通量測序，也叫“下一代測序”，最新的是三代測序，是一種快速測定大量DNA序列的技術，主要應用于DNA測序、RNA測序、表觀遺傳學等基因組測序及轉錄測序等，它有力地推動生物科學研究的發展，也與人類的生活與健康息息相關，在微生物與人體健康系統的生態平衡、新生兒疾病篩查、腫瘤的診斷與治療、遺傳病和耐藥性檢測等領域都有廣泛的臨床應用。
近日，寶德為世紀壇醫院升級打造的高性能計算集群系統，提供了堅實可靠的計算和存儲底座，助力醫院高通量測序更加快速精準，為加速醫院臨床科研和成果轉化奠定良好的基礎。
首都醫科大學附屬北京世紀壇醫院（文中簡稱“世紀壇醫院”）是集醫療、教學、科研、預防和保健為一體的三級甲等綜合醫院，擁有高水平的醫療專家人才隊伍，先進的醫療技術和設備、以及非常優秀的醫療水平，多次承擔國際醫療援助、精準扶貧與國內對口援助、大型醫療保障任務。同時，醫院堅持科研教學齊頭并進，不斷加強在醫學創新和科研項目的投入，并且加強國際合作，全力打造示范新型的現代臨床研究體系。世紀壇醫院原有IT系統的服務對象非常廣泛，既是各實驗室、各學科方向的科研支撐平臺，也是基因測序的核心計算和數據匯聚平臺，所以用戶數量很大而且離散度高、應用軟件種類多而雜。隨著科研業務發展和數據量的暴增，原系統在應對計算密集、網絡密集、IO密集、耦合密集型等不同硬件需求，以及高并發、快速實時響應等要求面前開始顯得無力，強穩定性、高擴展性和高度自動化運維的新型高性能計算集群呼之欲出。基于客戶實際需求的深入調研，考慮到新系統主要是為承擔實驗后期的高通量測序任務，同時要存儲測序后產生的日益增多的基因組數據，寶德為世紀壇醫院升級打造了高性能集群系統，該系統集合寶德高密度四子星計算服務器PR2720TW、寶德大內存計算服務器PR4865P、寶德分布式并行存儲PLStor、圖形工作站PT6630W、寶德交換機及寶德集群管理軟件于一體，整體可提供416個CPU計算核心、內存總量6.75TB、Tflops 峰值達29.08萬億次、并行存儲裸容量1050TB的計算和存儲算力；同時，系統采用100GB IB網絡，可以有效保障大模型大數據集的需求，并利用現有采用管理網絡，連接所有節點。此外，新系統配置的寶德集群管理套件，能提供集群的管理、監控、資源調度等使用接口和管理接口界面，非常方便客戶的日常運維，幫助客戶高效利用集群計算和存儲資源，并且有效降低成本。客戶表示，寶德高性能計算集群的硬件系統包含了登錄/管理節點、高密度計算節點、大內存節點、分布式并行存儲、千兆管理網絡、萬兆網絡等硬件設備，軟件系統包含了集群基礎環境軟件、集群系統管理軟件、分布式并行存儲系統軟件、生信分析軟件及流程中間件軟件等，二者合力能為醫院的高通量測序保駕護航。而且，在硬件系統上架安裝、布線、加電、確保與現有設備的有效連接，軟件集成的安裝和實施，應用系統的集成和系統優化、測試和多維度的項目培訓……在整個項目的交付和實施、測試過程中，寶德團隊表現了高度專業性和責任心，既滿足了醫院科研支撐平臺先進高效、穩定可靠的算力要求，又給科研工作和日常運維帶來了超出預期的增值服務體驗。科技的終極目標是服務于人類，高通量測序技術關系到人類基因和生命密碼。國家發改委《“十四五”生物經濟發展規劃》提出，要加快發展高通量基因測序技術，推動以單分子測序為標志的新一代測序技術創新，不斷提高基因測序效率、降低測序成本。寶德將繼續發揮自身在信息科技領域的技術優勢，攜手廣大合作伙伴，以更加先進的軟硬件產品方案和全棧服務為包括世紀壇醫院等在內的更廣泛醫療衛生行業客戶提供堅實的算力底座，助力中國醫療科技和醫學科研行穩致遠！
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